اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره‌ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی Fukuho-Komugi × Oligo-Culm با استفاده از نشانگرهای AFLP

Authors

  • رحیم ملک , مهدی
  • سید طباطبایی, بدر الدین ابراهیم
  • محمدی , سید ابوالقاسم
Abstract:

Genetic maps with high genome coverage are becoming increasingly useful in both basic and applied genetic researches. In the last decades, the advent of DNA markers has brought about a magnificent revolution in the production of genetic map, especially in wheat. In the present study, AFLP markers were used to saturate linkage map of 107 doubled haploid individuals produced through Fukuho _Komugi × Oligo – Culm crosses received from Japan International Research Center of Agricultural Science (JIRCAS). The framework of genetic map was used as base map for next analysis. AFLP analysis was performed with MseI / PstI as digestive enzymes. The average percentage of polymorphism with AFLP markers was around 16.6%. Data analysis was performed by computer program known as Mapmaker / EXP, Ver. 3.3. In this program, the maximum distance criterion was 50 cM and the minimum LOD equated 3. The drawing of chromosome schema for the linkage groups was performed by Draw map, Ver 1.1. In this analysis, 115 AFLP markers were divided into 10 groups in addition, some of the markers remained unlinked. The supplementary data analysis along with specific SSR markers identified the chromosome loci of the markers. Ultimately, 71.1% of the markers were assigned to genome A, 16.5% to genome B and only 3% to genome D. The AFLP markers filled 11 gaps in 7 chromosomes (2A, 3A, 7A, 2B, 3B, 5B and 7B). The low coverage of genome D was due to the limited polymorphism and its conservation in different populations. Among the chromosomes, maximum number of markers (60) was assigned to the chromosome 7A. The distribution of the markers on this chromosome was not uniform. Such a distribution was related to the grouping AFLP markers within heterochromatin region, particularly around the centromere.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

اشباع نقشه پیوستگی ریزماهواره ای گندم نان درجمعیت حاصل از تلاقی fukuho-komugi × oligo-culm با استفاده از نشانگرهای aflp

نقشه های ژنتیکی با پوشش بالای ژنوم نقش بسزایی در تحقیقات پایه و کاربردی ژنتیک ایفا می کنند. در دهه های اخیر با پیدایش نشانگرهای dna تحول عظیمی در تهیه نقشه های ژنتیکی در گیاهان مختلف به خصوص گندم به وجود آمده است. در این تحقیق، از نشانگر aflpبرای اشباع نقشه ژنتیکی 107فرد هاپلوئید مضاعف حاصل از تلاقی دو والد به نام های fukuho-komugi × oligo-culm دریافت شده از مرکز تحقیقات بین المللی کشاورزی ژاپن...

full text

اشباع نقشه ژنتیکی و مکان‌یابی ژن‌های کنترل کننده صفات با استفاده از خانواده‌های F3 حاصل از تلاقی بادیا×کویر

جو (L. vulgare Hordeum) یک گیاه مدل برای پژوهش‌های ژنتیکی و فیزیولوژیکی بوده و سازگاری بالایی بـه شـرایط مختلـف نـشان می‌دهد. به منظور مکان‌یابی QTLهای ژنومی‌ کنترل‌کننده صفات زراعی جو آزمایشی در سال زراعی 1396 - 1395 با 104 خانواده به همراه والدین آنها ( بادیا و کویر) در مزرعه تحقیقاتی دانشکده گنبدکاووس در قالب طرح اگمنت اجرا گردید. بیوماس، وزن سنبله‌، تعداد سنبله، طول سنبله‌، عملکرد دانه، طول...

full text

اشباع نقشه ژنتیکی و مکان‌یابی ژن‌های کنترل کننده صفات با استفاده از خانواده‌های F3 حاصل از تلاقی بادیا×کویر

جو (L. vulgare Hordeum) یک گیاه مدل برای پژوهش‌های ژنتیکی و فیزیولوژیکی بوده و سازگاری بالایی بـه شـرایط مختلـف نـشان می‌دهد. به منظور مکان‌یابی QTLهای ژنومی‌ کنترل‌کننده صفات زراعی جو آزمایشی در سال زراعی 1396 - 1395 با 104 خانواده به همراه والدین آنها ( بادیا و کویر) در مزرعه تحقیقاتی دانشکده گنبدکاووس در قالب طرح اگمنت اجرا گردید. بیوماس، وزن سنبله‌، تعداد سنبله، طول سنبله‌، عملکرد دانه، طول...

full text

بررسی نتایج حاصل از تلاقی دای‌آلل در گندم نان تحت شرایط تنش رطوبتی با استفاده از روش GGE-biplot

مقدمه از تلاقی‌های دای‌آلل جهت بررسی عمل ژن و تعیین گروه‌ها و الگوهای هتروتیک می‌توان استفاده نمود. دردهه‌ی اخیر استفاده از روش گرافیکی یا روش  GGE biplot  در بررسی اثر متقابل ژنوتیپ × محیط در برنامه‌های به‌نژادی متداول شده است. در این روش اثر ژنوتیپ و اثر متقابل ژنوتیپ و محیط از هم تفکیک‌شده و گزینش ارقام پایدار بر اساس هر دو اثر مذکور صورت می‌گیرد. زمانی که GGE biplot برای داده‌های دای‌آلل اس...

full text

نقشه یابی QTLهای متحمل به شوری در نتاج حاصل از تلاقی ارقام گاسپارد و خارچیا در گندم نان

For QTL mapping of related salt tolerance QTLs and determining the contribution of each QTL to phenotypic variation, a population consisting of 96 F2:3 families derived from the cross Kharchia (parent tolerant) and Gaspard (susceptible parent) were evaluated during 2 years. Of the 92 microsatellite markers used to evaluate parents, 32 markers were polymorphic which were used for analysis. Three...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}


Journal title

volume 12  issue 43

pages  565- 575

publication date 2008-04

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

No Keywords

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023